לשכת המדען הראשי מייצגת את משרד הבריאות בהתאגדויות (Consortia) של ארגונים מממני מחקר ממדינות האיחוד האירופי ומדינות נלוות שמטרתם לבסס ולקדם יצירת תשתיות לשיתופי פעולה מחקריים בתחומים שונים הקשורים למחקר רפואי.
פעילות ההתאגדויות (ERA-Nets), הממומנת על ידי נציבות המחקר של האיחוד האירופי, מתמקדת במיפוי הארגונים העוסקים במימון מחקרים בתחומים השונים בכל מדינה, השוואת הליכים וכללי מימון רצויים (Best Practices).
פעילויות אלה מכוונות להתארגנות המדינות השותפות לקראת פירסום "קול קורא משותף" (Joint Call) למימון מחקרים משותפים בין חוקרים מהמדינות השותפות.
