המנכ"ל ממונה על כל יחידות משרד הבריאות, ביניהן:
- מטה חטיבת הבריאות המקצועי
- משאבי בריאות
- מינהל ומשאבי אנוש
- מינהל הסיעוד
- לשכות הבריאות המחוזיות
- מוסדות האשפוז הממשלתיים
תפקידי המנכ"ל:
- אחריות על יישום מדיניות משרד הבריאות ועל תפעולה השוטף של מערכת הבריאות
- יועץ לשר הבריאות בהיבטים המקצועיים והארגוניים של מערכת הבריאות.
