מערך הכספים במערכת הבריאות, יהווה גוף מקצועי מוביל, הפועל ללא ליאות בהתמדה, ביצירתיות וחדשנות לשיפור ולקידום המערך הכספי על כל יחידותיו, ויהווה מנוע לביצוע מדיניות ומימוש ייעוד המשרד ומדיניות משרד האוצר, לשיפור השירות ללקוחותיו ולאזרחים ולמקבלי השירות במערך הרפואי.
הפעילות תושתת על הון אנושי ואינטלקטואלי מיומן ואיכותי אשר מדגיש את ערך הכבוד ההדדי, ההוגנות וההגינות. מערך הכספים יראה את עובדיו כגורם מרכזי בהתנהלותו ויפעל לקידומם החברתי והמקצועי.